378.基督教会从摇篮就开始被分裂主义和异端邪说攻击和分裂，随着时间推移，逐渐被撕裂和肢解，几乎就象经上说的那个从耶路撒冷下到耶利哥的人，他落到强盗手中，被剥去衣裳，打得半死，丢在半路（路加福音10:30）。这个教会的结局就象但以理书上所描述的：
那行毁坏可憎的，如飞而来，并且有忿怒倾在那行毁坏的身上，直到所定的结局。（但以理书9:27）
照主的话说：
然后末期才来到，你们看见先知但以理所说的“那行毁坏可憎的”站在圣地。（马太福音24:14,15）
它的命运好比一艘载满贵重货物的船只，一离开港口就遭到暴风雨袭击，很快就失事沉入海底，致使满船货物部分被海水毁灭，部分被鱼吞吃。
教会历史清楚告诉我们，基督教会自婴孩时就经历风雨飘摇，遭受重大打击。例如，使徒时代的西门，他是撒玛利亚人，在城里久行邪术（参看使徒行传8:9等）；还有保罗在写给提摩太的信中所提到的许米乃和腓理徒（提摩太后书2:17-18）；还有名为尼哥拉党人的尼哥拉（启示录2:6；使徒行传6:5），以及克林萨斯。使徒时代之后，更多的异端邪说兴起，例如马西昂派（Marcionites）、奴爱达派（Noetians）、瓦伦丁派（Valentinians），禁戒派（Encratites），孟他奴派（Cataphrygians），守逾越节派（Quartodecimas？？暂译）、非道派（Alogians）、迦他利派（又作亚尔比根派，清洁派）（Catharans）、奥利金派（又译俄利根）（Origenists）、撒伯流派（Sabellians）、撒摩撒他派（Samosatenes）、摩尼教（Manichaeans）、麦勒先派（Meletians），直至阿里乌派（Arians）。在他们的时代之后，整个异端领袖团开始攻击教会，如多纳徒派（Donatists）、阜提奴派（Photinians）、半亚流派（Semiarians）、优诺米派（Eunomians）、马其顿派（Macedonians）、聂斯托利派（Nestorians）、预定论（Predestinarians）、教皇制信奉者（Papists）、茨温利派（Zwinglians）、再洗礼派（Anabaptists）、施文克斐特派（Schwenckfeldians）、合作派（？？Synergists暂译）、苏西尼派（Socinians）、反三一论派（Antitrinitarians）、贵格会派（Quakers）、赫伦胡特派（Herrenhuters）等等。最后，路德（Luther）、梅兰希顿（Melanchthon）和加尔文（Calvin）胜了其它教派，如今他们的教义占据主流。
导致教会分歧和分裂的根本原因有三个：第一，对圣三一的误解；第二，缺乏对主的正确认识；第三，十字架受难是救赎的实际过程的谬念。这三个问题是信的根本，教会基于它们而存在，并被称为教会。对它们的无知必然导致属教会的所有事物背离正轨，最终走向反面，而教会却仍然认为自己拥有对神和关乎神的一切真理的正信；此时，这些人就象蒙上双眼的人，自以为走的是直线，殊不知正在一步步背离它，最终转向相反的方向，那里有大坑等着他们掉进去。不过，能把教会中人从背离真道的路上拉回来，唯一的方法就是学习何为正信，何为不正当之信，何为伪信。故按下列顺序说明：
⑴正信只有一个，就是信主神救主耶稣基督，是那些信祂是神的儿子，天地之神，与父为一之人所持守的。
⑵不正当的信是指背离独一正信的一切信，这就是那些从别处爬进来，仅视主为人，而非神之人所持守的信。
⑶伪信根本就不是信。

491.神不但将自由植入在人类里面，还植入在所有动物里面，甚至将类似自由之物植入在无生命的物体中，使各自能照其性质接受它；因为神将良善供给万有；是物体本身将这良善转为邪恶。这一点可通过对比来说明:大气将呼吸的能力赋予每个人，同样赋予所有动物，无论家养的还是野生的，也赋予所有鸟类，猫头鹰与鸽子一样；大气还赋予鸟类飞翔的能力。然而，不是大气使它的馈赠被具有相反性质和特性的生物所接受。海洋本身为所有鱼类提供居所，并供应食物；但海洋并没有让这鱼吞食那鱼，或让鳄鱼将食物变成杀人的毒药。太阳为万物提供光和热，但它所作用的物体，如地上的各种植物，却以不同方式接受它们；好树或好的灌木以这种方式接受，荆棘或蒺藜却以那种方式接受；无害的草本以这种方式接受，有害的草本则以另一种方式接受。
雨水从高处的大气层落到地面，地由此向一切树木、植被和草本提供水份，它们按照所需的来汲取。这就是所谓类似于自由意志的功能，因为它们通过小口、气孔和导管（它们在温暖的季节会敞开）自由汲取雨水，地仅仅供应液体和元素，植物出于一种饥渴吸收它们。这和人差不多，因为主以本质上为爱之善的属灵之热和本质上为智之真的属灵之光流入每个人；而人却照着他是转向神还是转向自我来接受这些事物。所以，主在教导对邻之爱时说:
你们可以作天父的儿子；因为祂叫日头照好人，也照歹人；降雨给义人，也给不义的人。（马太福音5:45）
在别处，祂说祂渴望拯救所有人。